Sibirski znanstveniki so pri Evropejcih odkrili gen za depresijo

Po ocenah Svetovne zdravstvene organizacije po svetu zaradi depresije trpi 350 milijonov ljudi, pri 30-40% ljudi pa se bolezen razvije zaradi genetskih dejavnikov. Znanstveniki z Inštituta za celično biologijo in genetiko v Novosibirsku so odkrili gen, ki vpliva na razvoj depresije pri Evropejcih.

Novi gen so poimenovali NKPD1. Ker so za raziskovanje uporabili gensko gradivo Evropejcev, znanstveniki pravijo, da Mongoloidi (Azijati) in Negroidi (ljudje s črno ali rjavo barvo kože) takšnega gena nimajo. Pri njih je za depresijo odgovoren drug gen, ki ga je potrebno še odkriti.

Znanstveniki upajo, da bo odkritje pripomoglo k razvoju zdravil proti široko razširjeni bolezni. V raziskavi so uporabili metode genetske analize, ki so jih razvili na sibirskem inštitutu.

Gen kontrolira depresijo

V iskanju »depresivnega gena« so sibirski genetiki-matematiki analizirali podatke okoli 2000 ljudi. Dostavil jih je nizozemski center Erasmus iz Rotterdama, ki se ukvarja s preučevanjem depresije.

V Sibiriji razvijajo umetno kožo

»Nismo začeli ločeno preučevati vsake genetske različice posebej, kot to običajno počnejo v takšnih raziskavah. Namesto tega smo vzeli gen v celoti in smo preučevali samo te genetske različice, ki menjajo strukturo pripadajočih beljakovin. Še ena posebnost je v tem, da smo se osredotočili na tako imenovane depresivne simptome, ne pa na potrjeno diagnozo,« je za RBTH pojasnila vodja raziskave in doktorica biologije Tatjana Aksenovič.

Da bi identificirali gen, ki kontrolira depresijo, je doktorica biologije Nadežda Belonogova razvila program FREGAT. Vanj so vključili tako metode »regionalne analize povezav«, v katerih analizirajo celoten gen, kot tudi vse nove metode, ki so jih razvili med procesom raziskave.

Po besedah sibirskih znanstvenikov je program omogočil zelo hitro prebiranje podatkov: iskanje gena NKPD1 je trajalo samo nekaj ur. Veliko več časa je za potrditev potreboval nizozemski center Erasmus, ki je potrdil rezultat na neodvisnem vzorcu ljudi.

Fregata v boju proti boleznim

Znanstveniki pravijo, da je depresija s stališča genetike unikatna bolezen. Genski dejavniki na razvoj depresije vplivajo približno toliko kot pri shizofreniji. Našli so že na desetine genov, ki nadzorujejo pojav in razvoj shizofrenije. Za depresijo pa do sedaj niso verodostojno potrdili niti enega.

»V naši raziskavi smo kot prvi odkrili gen, ki spreminja strukturo beljakovin. Do danes so znanstveniki identificirali le lokuse, se pravi delce genomov. Mi pa smo identificirali ravno gen, se pravi spremembe v strukturi beljakovin. To odpira možnosti za usmerjene terapije in razvoj zdravil, ki bodo nekako popravljala te napake,« razlaga Aksenovičeva.

Ruski znanstvenik želi z novo tehnologijo dočakati 150 let

Sibirski znanstveniki ne nameravajo nadaljevati raziskav na tem področju. Njihova glavna specializacija je razvoj statističnih metod za analize in novih programskih paketov. Pridobljene podatke o depresiji so objavili v znanstveni reviji Biological Psychiatry in jih sedaj posredujejo kolegom, ki se ukvarjajo z raziskovanjem te bolezni.

Programski paket FREGAT se sedaj nahaja v mednarodnem arhivu programov CRAN (the Comprehensive R Archive Network) in je na voljo v odprtem dostopu. Sname in uporablja ga lahko katerikoli znanstvenik. Razvijalci pojasnjujejo, da bi lahko s programom odkrivali tudi gene, ki so odgovorni za druge bolezni.